Co wygaszanie interpretacji indywidualnych dotyczących ulgi B+R oznacza dla podatników?

W artykule odpowiadamy na pytania:

• Dlaczego DKIS wygasza masowo interpretacje indywidualne dotyczącej ulgi badawczo-rozwojowej?
• Czy można wnioskować o ponowne wydanie wygaszonej interpretacji indywidualnej?

W ostatnich miesiącach Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej rozpoczął masowe wygaszanie interpretacji indywidualnych dotyczących ulgi badawczo-rozwojowej (tzw. ulgi B+R). I choć to podejmowane przez DKIS działanie jest bezpośrednio powiązane z wydaniem przez polskie Ministerstwo Finansów interpretacji ogólnej, to rodzi mimo wszystko poważny problem, ponieważ proces wygaszania interpretacji indywidualnych dotyczy także tych rozstrzygnięć, które swoim zakresem wykraczają poza tematykę interpretacji ogólnej. Co to oznacza dla podatników, których interpretacja ulgi B+R została wygaszona? I co mogą w tej sytuacji zrobić?

Interpretacja ogólna dotycząca polskiej ulgi badawczo-rozwojowej

Na wstępie przypomnijmy, że Ministerstwo Finansów wydało 13 lutego 2024 r. interpretację ogólną o znaku DD8.8203.1.2021. Określa ona możliwości zaliczenia wydatków ponoszonych przez podatników na wynagrodzenia za czas urlopu oraz choroby do kosztów kwalifikowanych ulgi badawczo-rozwojowej. 

Interpretacja ogólna obejmuje relatywnie wąski zakres tematyczny i odnosi się tylko do części wydatków kwalifikowanych ulgi B+R. 

Wygaszanie interpretacji indywidualnych przez DKIS

W związku z wydaniem wskazanej interpretacji ogólnej, Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej zaczął masowo wygaszać wcześniejsze interpretacje indywidulane, które podejmowały temat ulgi B+R. 

Najwięcej kontrowersji budzi jednak fakt, że Dyrektor KIS podjął decyzję o stwierdzeniu wygaśnięcia w całości nawet tych interpretacji indywidualnych, które obejmowały też inne, nieporuszone w interpretacji ogólnej, zagadnienia związane z ulgą B+R. Wygaszane interpretacje często dotyczyły np. klasyfikacji innych kosztów kwalifikowanych albo rozstrzygały, czy dany podatnik prowadzi działalność badawczo-rozwojową. 

Skutki wygaszenia interpretacji indywidualnej dotyczącej ulgi B+R

Dyrektor KIS poprzez swoje szeroko zakrojone działania sprawia, że podatnicy, którzy dotychczas korzystali z ochrony gwarantowanej przez interpretację indywidualną w zakresie B+R, teraz tę ochronę tracą. 

Jest to spowodowane tym, że – jak już wcześniej to podkreślaliśmy – wygaszane interpretacje indywidualne obejmują znacznie szerszy zakres zagadnień niż ten wskazany w interpretacji ogólnej opublikowanej przez MF. Podatnicy mogą co prawda ponownie ubiegać się o wydanie interpretacji indywidualnej w zakresie tych poruszanych w wygaszonej interpretacji indywidualnej zagadnień, które nie zostały objęte interpretacją ogólną, jednakże podatnik nie może mieć pewności, że stanowisko Dyrektora KIS nie ulegnie zmianie w stosunku do pierwotnej interpretacji.

Co zrobić w przypadku otrzymania postanowienia o stwierdzeniu wygaśnięcia interpretacji indywidualnej?

Każdy podatnik, który otrzyma od organu podatkowego postanowienie o stwierdzeniu wygaśnięcia interpretacji indywidualnej, może (w terminie 7 dni) złożyć do Dyrektora Krajowej Izby Skarbowej zażalenie. Zachowanie przewidzianego terminu jest w tym przypadku niezwykle istotne – po upływie 7 dni złożenie zażalenia nie będzie możliwe. 

Jeśli DKIS odrzuci zażalenie podatnika, to kolejnym krokiem jest złożenie skargi do sądu. 

Dobrą wiadomością dla skarżących może być fakt, że wiele sądów staje po stronie podatników. Znamy aktualnie wyroki stwierdzające, że choć ustawodawca z jednej strony nie wprowadził regulacji umożliwiającej wygaszenie interpretacji indywidualnej „w części”, to – z drugiej strony – nie wprowadził zakazu częściowego stwierdzenia jej wygaśnięcia. Sądy wskazują także, że nieracjonalne by było, gdyby za każdym razem, gdy interpretacja indywidualna straci na aktualności tylko w określonym zakresie, organ miał stwierdzać jej wygaśnięcie w całości. 

Rozstrzygnięcia prowadzonych do tej pory sporów dają duże nadzieje na wygranie sprawy sądowej przez podatnika i zachowanie ochrony gwarantowanej przez interpretację indywidualną w tej części, która nie jest rozstrzygnięta w interpretacji ogólnej.

W przypadku pytań, chęci złożenia zażalenia na postanowienie o stwierdzeniu wygaśnięcia interpretacji indywidualnej lub potrzeby przeprowadzenia analizy wpływu interpretacji ogólnej na Państwa rozliczenia w zakresie ulgi B+R, gorąco zachęcamy do kontaktu z naszymi ekspertami.